Oscar Lostes Cazorla
Enginyeria Informàtica i Enginyeria Electrònica de Telecomunicació amb Màster en Tecnologies Avançades de Telecomunicació
Arquitectures heterogènies per a l’acceleració de l’alineament de seqüències ultra-llargues
Arquitectures heterogènies per a l’acceleració de l’alineament de seqüències ultra-llargues
Descripció
Aquest projecte se centra en el disseny d'un accelerador personalitzat i específic de domini per accelerar les tasques d'alineació de seqüències descarregant les parts intensives en càlcul i memòria a maquinari especialitzat. L'enfocament implica modelar i simular arquitectures híbrides utilitzant GEM5, per després implementar dissenys RTL, verificar-los i avançar cap a la síntesi física i la validació del disseny. El seu component connecta el processament de propòsit general i l'acceleració de maquinari, aprofitant el paral·lelisme de bits i les optimitzacions de programació dinàmica adaptades a les càrregues de treball d'alineació genòmica.Context
L'Oscar va completar els seus graus d'Enginyeria Informàtica i Enginyeria Electrònica de Telecomunicació i posteriorment va cursar un Màster en Tecnologies Avançades de Telecomunicació, on es va especialitzar en el disseny digital de sistemes integrats i l'acceleració de maquinari. L'Oscar té una àmplia experiència en arquitectura de maquinari, disseny digital i entorns de simulació. Ha treballat amb arquitectures RISC-V i ha dissenyat acceleradors utilitzant fluxos de desenvolupament RTL, modelatge de maquinari i verificació. La seva experiència li permet navegar per la pila completa, des de la visió algorítmica d'alt nivell fins a la implementació de maquinari.Iniciativa
Les càrregues de treball bioinformàtiques actuals, particularment l'alineació de seqüències de cadenes d'ADN ultra-llargues, exigeixen marcs de computació que les CPU o GPU convencionals tenen dificultats per gestionar de manera eficient. L'Oscar està motivat pel repte d'ampliar els límits dels acceleradors de maquinari personalitzats, conciliant la innovació algorítmica amb la implementació física. Busca fer més eficient l'anàlisi genòmica d'alt rendiment, reduint el cost, la potència i la latència, i facilitant així els avenços en medicina de precisió i genòmica a gran escala. Els interessos de recerca de l'Oscar inclouen arquitectures heterogènies, arquitectures RISC-V, disseny de maquinari específic de domini i acceleradors de maquinari per a l'alineació genòmica.
Organització
Supervisió
Santiago Marco-Sola
UPC supervisor
El contingut d'aquest lloc web reflecteix únicament els punts de vista del projecte Catedra Chip Chair UPC.
