Álvaro Lucas Barceló
Estudiant Doble grau en Biotecnologia i Enginyeria Informàtica
Avaluació del rendiment i optimització d’acceleradors heterogenis per a càrregues de treball genòmiques
Avaluació del rendiment i optimització d’acceleradors heterogenis per a càrregues de treball genòmiques
Descripció
Aquest projecte se centra en l'avaluació del rendiment i l'optimització d'acceleradors heterogenis aplicats a la bioinformàtica i la genòmica. L'Álvaro contribueix mitjançant l'execució de benchmarks, la creació de perfils d'aplicacions i la validació de sistemes que integren acceleradors de maquinari per a càrregues de treball intensives com ara l'alineació de seqüències i l'anàlisi de pangenomes. Gràcies a la seva doble formació en biotecnologia i enginyeria informàtica, també assessora l'equip sobre casos d'ús, aplicacions biològiques i escenaris de validació, assegurant que els esforços d'acceleració de maquinari es mantinguin alineats amb les necessitats biomèdiques del món real. A més, col·labora en l'avaluació i implementació de tècniques d'optimització, amb un èmfasi particular en l'acceleració de tasques d'alineació de seqüències. El seu treball dona suport al desenvolupament de pipelines genòmics robustos i d'alt rendiment que combinen l'eficiència computacional amb la rellevància biològica.Context
L'Álvaro està cursant l'últim any del doble grau en Biotecnologia i Enginyeria Informàtica a la Universitat Rovira i Virgili (URV). Els seus estudis combinen biologia, genètica i biotecnologia amb programació, algorismes i anàlisi de dades, complementats per un gran interès en les matemàtiques. Ha adquirit experiència en recerca tant al Barcelona Supercomputing Center (BSC) com al Centre de Regulació Genòmica (CRG), on va treballar en algorismes i heurístiques aplicats a la bioinformàtica. Aquesta formació interdisciplinària el capacita per connectar les ciències de la vida i la computació d'alt rendiment, aportant coneixements únics a la validació i optimització de càrregues de treball genòmiques.Iniciativa
L'Álvaro va triar aquest camí de recerca per una gran curiositat sobre com els mètodes computacionals poden fer avançar la comprensió biològica. Està motivat pel repte de fer que les anàlisis genòmiques siguin més ràpides, eficients i precises, permetent avenços en àrees com ara els estudis genètics, la detecció de mutacions i la recerca de pangenomes. Combinant la seva experiència en biotecnologia i enginyeria informàtica, contribueix tant tècnicament com científicament, assegurant que el desenvolupament d'acceleradors estigui estretament connectat amb les necessitats de les aplicacions biomèdiques del món real. Els interessos de recerca de l'Álvaro inclouen aplicacions bioinformàtiques, benchmarking i avaluació del rendiment, alineació de seqüències, anàlisi de pangenomes i acceleradors heterogenis en HPC.
Organització
Supervisió
Santiago Marco-Sola
UPC supervisor
El contingut d'aquest lloc web reflecteix únicament els punts de vista del projecte Catedra Chip Chair UPC.
